O Flatpak é instalado por padrão no Manjaro 20 ou superior.
Para habilitar o suporte, navegue até o Gerenciador de Software (Adicionar/Remover Programas)
Clique no menu de três linhas [ou pontos dependendo do Ambiente de Trabalho] à direita; no menu suspenso, selecione "Preferências"
Navegue até a aba "Flatpak" e deslize o botão para Habilitar suporte ao Flatpak (também é possível habilitar a verificação de atualizações, o que é recomendado).
Para concluir a configuração, reinicie seu sistema. Agora, tudo o que você precisa fazer é instalar os aplicativos!