Flatpak jest domyślnie zainstalowany w T2 SDE od wersji 26.6 — nie wymaga żadnej konfiguracji!
Flatpak jest fabrycznie skonfigurowany z repozytorium Flathub i zawiera narzędzia do integracji z pulpitem, umożliwiające instalację z Flathub za pomocą jednego kliknięcia.