Paigaldamaks Flatpakki GNU Guixis, ava terminalirakendus ja käivita:
guix install flatpakFlathub on parim koht Flatpaki rakenduste leidmiseks. Kasutuselevõtmiseks käivita:
flatpak --user remote-add --if-not-exists flathub https://dl.flathub.org/repo/flathub.flatpakrepoFlatpaki paigaldamise lõpetamiseks käivita arvuti uuesti. Nüüd polegi muud teha, kui hakka rakendusi paigaldama!
Märkus: Flatpaki rakenduste paigaldamise graafiline kasutajaliides ei pruugi GNU Guixi puhul toimida.