elementary OS 5.1 a novšie prichádza s predinštalovanou podporou Flatpaku. Pre neoverené aplikácie postupujte podľa Flathubu na inštaláciu akejkoľvek aplikácie pomocou veľkého tlačidla „Nainštalovať“ a otvorte stiahnutý súbor `.flatpakref` pomocou Sideload.
Poznámka: Po inštalácii jednej z aplikácií z vzdialeného repozitára, ako je Flathub, sa všetky aplikácie z daného repozitára zobrazia v Centre aplikácií.