elementary OS 5.1 a novšie verzie prichádzajú s podporou Flatpaku priamo v základe. Pre aplikácie mimo kurátorského výberu prejdite na Flathub, nainštalujte ľubovoľnú aplikáciu pomocou veľkého tlačidla „Inštalovať“ a otvorte stiahnutý súbor `.flatpakref` pomocou aplikácie Sideload.
Poznámka: Po inštalácii jednej aplikácie zo vzdialeného úložiska, ako je Flathub, sa všetky ostatné aplikácie z tohto úložiska automaticky zobrazia aj v Centre aplikácií.