A flatpak-csomag elérhető a Pisi 2.1-es és újabb verzióiban. A telepítéshez futtassa a következőt rootként:
sudo pisi it flatpakA Flathub a legjobb hely a Flatpak alkalmazások beszerzésére. Az engedélyezéséhez futtassa:
flatpak remote-add --if-not-exists flathub https://dl.flathub.org/repo/flathub.flatpakrepoA beállítás befejezéséhez indítsa újra a rendszert. Most már csak alkalmazásokat kell telepítenie!
Megjegyzés: Előfordulhat, hogy a Flatpak alkalmazások grafikus telepítése nem lehetséges Pisi GNU/Linux rendszeren.