A Flatpak alapértelmezetten telepítve van a Fedora Workstation, Fedora Silverblue és Fedora Kinoite rendszereken. A kezdéshez mindössze annyit kell tennie, hogy engedélyezi a Flathubot, amely a legjobb módja a Flatpak alkalmazások beszerzésének. A Flathub előre be van állítva a harmadik féltől származó tárolók részeként. Alternatívaként letöltheti és telepítheti a Flathub-tárolófájlt.
Most már nincs más dolga, mint alkalmazásokat telepíteni!
A fenti hivatkozásoknak működniük kell az alapértelmezett GNOME és KDE asztali környezettel rendelkező Fedora telepítéseken, de ha valamiért mégsem, akkor kézzel is hozzáadhatja a Flathub tárolót a következő parancs futtatásával: