Marknote le permite crear notas de texto enriquecido y organizarlas fácilmente en cuadernos. Puede personalizar los cuadernos eligiendo un icono y un color de acento para cada uno, lo que facilita distinguirlos y mantener las notas al alcance de la mano. Las notas se guardan como archivos Markdown en la carpeta Documentos, lo que facilita su uso fuera de Marknote así como dentro de la aplicación.